在职硕士培养质量形成于整个培养的过程中，其影响因素很多，从系统的观点出发，培养质量不仅包括在职硕士自身，还包括培养条件及培养过程管理的质量。有学者运用系统分析的方法将在职硕士培养质量影响因素归纳为:学科建设、教学环节、管理体系三个层次。
1、学科建设
学科建设是建设一流大学的根本任务。在在职硕士的教育工作中，学科建设包括导师队伍建设、科学研究、学术交流、条件建设四方面。其中，导师队伍建设又是学科建设的关键，对在职硕士教育成败起决定性作用。
2、教学环节
教学环节是在职硕士培养的主要环节，包括招生阶段、教学工作、论文写作。在职硕士在导师指导下，结合培养方案及目标制定培养计划，并且执行培养计划，提高自己的学术水平和科研实践的能力。导师在在职硕士培养中是指导者，也是培养质量的第一管理者。
3、管理体系
管理体系包括政治思想、规章制度、管理队伍、教学文件、教学管理。其中教学管理又分为招生管理、学籍管理、培养管理、学生事务管理、学位授予管理、学科建设管理。
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