首先，修订完善《合肥工业大学在职硕士教育创新工程实施方案》，进一步加强产学研合作，遴选一批有科技实力和较大社会影响的研究院<服和企业联合培养博士和硕士，建立和完善产学研结合培养在职硕士的模式。推进在职硕士开放实验室的使用，完善管理规定，加大宣传力度，提高使用效率。根据学校实际情况，继续有重点地建设若}几在职硕士开放实验室。继续使用好在职硕士科技创新基金，有重点的实施“优秀学位论文培育计划”、“优秀学位论文奖励项目”、“优秀博士论文出版资助项目”等项目。加强与著名企业和科研院所的合作，建立在职硕士校外创新实践基地。
其次，以培养在职硕士的创新思维和创新意识为核心，从教学内容、研究实践和学习方式上形成有利于提高在职硕士创新能力的环境从在职硕士参与导师科研项目情况，学位论文的选题，发表高水平的学术论文，中请专利，撰写项目中请书，提出新的理论和方法，研制新的机构、装置和产品，获得各类比赛奖励等方面入手，提出创新能力培养环节的要求，制定创新能力评价的标准。
第三，严把在职硕士学位论文选题关，通过选题来提高在职硕士发现问题、提出问题、分析问题的能力。导师必须站在学科的前沿，提供学位论文选题信息，指导在职硕士选题。导师应鼓励在职硕士自卞选题，在职硕士要在导师的指导下，搜集资料、独立思考、大胆设想、找准国内外空白点。
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