在我国在职硕士培养方面，一般采取导师负责制的培养方式，在职硕士的论文完成甚至生活、就业都渗透着导师的心血。导师自身的创新精神、知识更新速度和人格魅力对于培养在职硕士的创新能力起着至关重要的作用。
但是，科研院所在在职硕士导师队伍建设上也存在一些问题，主要表现在:一是有些导师知识结构老化，又不注重对学术前沿的追踪，创新能力不强;二是对导师资格审核中，只注重导师职称、科研经验、研究成果等方面的要求，而对导师的协作能力、责任心、知识结构等重视不够;三是有些导师科研条件较差，不具备完成一些创新性论文所必备的条件;四是导师担任的行政职务过多，再加上从不同渠道招收的在职硕士数量太多，时问精力有限，往往无暇对自己的在职硕士进行悉心指导;五是有的导师把自己的在职硕士充当高级临时工，一切以自身的利益为核心，漠视在职硕士的利益，造成师生关系紧张，不仅影响在职硕士与导师的交流，甚至造成不良后果。
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