有论者基于调查指出，我国现行的在职研究生培养模式存在着“本科化”现象。课程体系与培养模式具有很大的内在一致性，因此在职研究生教育信息网老师认为，在职研究生教育课程体系具有较浓的“本科化”色彩。所谓在职研究生教育课程体系的“本科化”，是指在职研究生课程体系在目标、结构、实施和评价四个要素上所体现出来的基于本科教育本质的一系列特征的总称。其主要体现在课程内容、课程实施以及课程形式等各个方面。
(1)课程内容的“本科化”.课程内容“本科化”主要表现在三个方面:一是硕士阶段课程内容与本科阶段大量重复，这一现象对于那些本硕就读于同一学校的硕士生来说尤为突出。二是课程内容在难度上与本科差距不大。无论是属于同一学科考取，还是跨学科考取，大部分硕士生都认为其所学课程内容与本科没有多大差距，很少有学生反映所学课程较难或很难。在职研究生教育部分课程内容的高深层性只是体现在对本科生课程内容在横向层面上作平面式的扩展上，并没有凸显在职研究生教育在课程内容上的要求和特色。②三是前沿性知识在专业课程中所占比重不高。有超过一半的硕士生认为其专业课程内容中的前沿性知识比重过少，相当大比例的博士生也持有这一看法。
(2)课程教学的“本科化”。在职研究生课程教学的“本科化”主要体现在两个方面:一是教学方式的“本科化”。在职研究生“专业课最常采用的教学方式”以“讲授为主，讨论为辅”，其中硕士在职研究生的教学方式，基本同本科生没有多大差异。通过访谈我们还发现，在职研究生之所以对英语和政治等全校性公共课程教学不满，其重要原因就是:那种纯讲授式的、不注重在职研究生教育特点的“本科化”教学方式。二是教学要求“本科化”，对在职研究生缺乏与之相应的严格要求。具体体现在课堂上，讨论不能走向深入，学生没有也不被强烈要求进行积极思维:在课外，对学生并没有严格的文献阅读或实践实验要求;在科研活动中，许多在职研究生从事的是那些常规性的阶段性工作，他们难以获得全程从事具有挑战性课题研究的机会。此外，考核作为一项具有特别作用的教学要求，教师对其实施有失严格，考核不太规范，导师手下留情，学生通过的概率几乎为百分之百。
(3)课程形式的“本科化”。主要表现在如下几个方面:①课程设置门数过多。许多高校的在职研究生培养方案显示，硕士生在校期间通常要求完成15^20门左右的课程。如此多的课程门数将会使在职研究生忙于应付上课，而没有较多时间进行课外自学和从事科学研究。此外，硕士学制的普遍缩短也内在要求课程设置门数的减少。②课程体系结构与本科雷同。目前我国的在职研究生教育课程体系结构与本科基本一样，由公共基础课程、专业基础课程、专业课程以及选修课程构成，这一课程体系结构的主要特点是，按建立学科基本框架的要求进行课程设置，致力于学生统地掌握本专业的知识结构，而较少顾及到如何根据在职研究生的兴趣或其研究领域的需要去形成一个有着内在联系的知识整体。这一课程结构形式有利于学生获得较为宽广的知识、但难以引导学生的研究走向深入。
由上可知，课程体系的“本科化”主要体现为:课程内容与本科大量重复，课程难度小;实施以知识传授为主的讲授式教学，对学生要求低;课程体系结构不太利于学生研究的深入及其研究兴趣的培养，课程门数偏多。当然，以上问题主要体现在硕士在职研究生的课程体系之中，而对于许多专业的博士在职研究生课程体系而言，则呈现出一定的“硕士化”倾向。总之，课程体系缺乏“层级性”，这是我国目前在职研究生教育课程体系中存在的一个十分突出的问题。
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