经过几年来的探索与实践，工程硕士从招生录取到学籍、培养成绩管理，论文评审及答辩、学位授予，基本建立了一套较完善的培养管理体系。但在发展过程中还存在着一些制约性因素，如发展理念因素、管理运行机制因素、教学模式创新因素、专业师资队伍建设因素等，这些制约性因素已经影响到工程硕士教育的健康发展，仍需通过进一步建立健全规章制度和科学的管理体系来促进工程硕士培养质量的提高。
由于工程硕士研究生与普通研究生管理工作存在一定差异，必须针对工程硕士专业学位研究生教育在招生、培养、学籍、学位授予等方面的特殊性，积极进行管理工作的探索与创新，需要进一步完善各种规章制度和章程，建立一套层次清晰、职权明确、体系创新的工程硕士运行机制和科学的管理模式，不断提高工程硕士教育质量。
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