中国科人工程硕士的培养、主要是面向国家重要产业、重人工程、国防等重要领域，在培养过程中，形成了一整套面向产业需求的项目设计与项目反馈体系，保证了工程硕士培养与产业需求之间的高度契合。
1、企业参与项目设计
中国科人的工程硕士的招生人都是直接与重要产业、行业相合作，从招生开始就与委托培养单位洽谈企业的需求，了解学员的原有基础，委托单位期望学校在哪些能力方面加强培养，广泛地与委托单位就培养方案、课程设计、培养方式开展研讨，形成双方认可的培养方案与项目实施计划，把企业需求有效地纳入工程硕士培养的全过程之中，提高了工程硕士的培养质量，使工程硕士培养更具针对性。
2、面向产业需求的师生互动
工程硕士学员通常具有丰富的实践经验，拥有在特定领域内丰富的工作经验及社会阅历，这是普通全日制学生不具备的。同一专业的学员基本来自于同一行业，并来自全国各地，原先学科专业既有相同性，又有差异性，这样在学习过程中，教师可以很好地发动学生之间的交流与匀_动，促进他们之间的相匀_学习与共同提高。
针对工程硕士学员自身特色，学校建设了一支经验丰富、结构合理的“三结合”(专职和兼职、理论和实战、消防部队和学校教师三结合)教学师资与导师队伍，并在开展教学过程中针对学员特点，创新教学模式，开展师生匀_动。通过这些匀_动，学员与教师之间就教学内容、教学方法等逐步达成默契，学员会根据自身的需求提出问题，教师针对这些问题，及时调整讲课内容，重点讲解学员们关心的实践问题。
3、理实交融的论文研究工作
一是采取双导师指导方式:学校在工程硕士学位论文指导中采用双导师的指导方式，除了校内导师之外，每位学员还配有一名来自业界具备高级技术职称的导师。校内导师主要负责指导学员的课程学习、论文选题(会同企业导师)、开题报告、中期检查及论文的理论建构部分等行业导师主要负责指导学员的工程实践、工程管理、论文选题(会同校内导师)及论文的实践研究部分等。通过双导师制度，使得论文选题、论文研究等都密切结合行业实际。二是提供论文选题与工程实践相结合:论文要本着源于工程、服务于工程的原则，从选题、开题报告、中期检查、评审、论文答辩等各环}犷入手，结合行业和学校导师的意见，鼓励学员直接从相关工程领域的生产实践中选取论文题目，或者选取具有明确的生产背景和应用价值的课题;同时，导师会注意论文选题的技术难度、前沿性与工作量，以达到培养学员具备综合运用工程理论、方法及技术手段解决实际问题的能力。工程硕士的论文选题、指导与评价原则为:“工程性、实践性、应用性”相结合，力求每篇工程硕士学位论文都具备“个性”和“闪光点”。
4、产学合作的项目反馈
为了确保工程硕士的培养与社会需求的契合度，进一步提升工程硕士的培养质量及发展质量，学校建立了工程硕士项目的评价与反馈系统，专门设立了“工程硕士培养质量研究小组”，研究提高工程硕士培养质量的相关课题，有效地保证了产业、学校、科研的高度结合。工程硕士项目的评价与反馈系统，主要有三人渠道:一是工程硕士毕业生的信息反馈，学校会定期与工程硕士毕业生联系，了解在校学习对他们工作能力的提升情况，在校培养的不足之处，及社会需求的发展动向帐二是企业负责人的信息反馈，通过与工程硕士毕业生的领导联系，了解他们在校学习是否有助于提升工程实践能力、提升程度如何以及还需提升的方面煞三是联合培养项目组的信息反馈，鉴于校企合作的工程硕士联合培养是长期性的项目，企业亦会及时地反馈信息，共同调整培养方案、培养计划，以提高工程硕士项目的培养效果。一旦工程硕士项目的培养效果欠佳，企业可能会选择中委托培养项目。
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