在职硕士创新素质教育机制是一种现代意义上的系统控制概念，是指在在职硕士创新素质教育系统中，为维持系统的正常存在与运行，并保证在职硕士创新素质教育这一系统功能的有效实现，而建立的以一定的行为制度规范系统内各组成要素间地位及功能上的关系、协调各要素间相互作用、调节系统与环境能量交流的调控方法或控制环节。简单地说，就是最优化的处理在职硕士创新素质教育过程中教学事务、管理事务、行政事务等的一系列方法、制度和环节的总和。
在这里，在职硕士创新素质教育机制可以以一种系统内部结构及其相互关系的描述形式出现，从几何角度形象化了在职硕士创新素质教育系统主客体的架构，将教育理念、教育组织、教育机构、教育资源等要素清晰地呈现在三维立体平台中，形成最适合功能发挥的结构形式。同时，在职硕士创新素质教育机制又可以以大量教学实践方面实体化了的创新教育规律性制度形式出现，指导和规范着整体事务的运行，以确保系统功能的实现。
应该指出的是，在职硕士创新素质教育机制并不是单一的简单体，而是由几类不同机制联合起来，共同形成的在在职硕士创新素质教育系统中起作用的完整运行体系。按照各类机制在在职硕士创新素质教育中所起作用的不同，可以将在职硕士创新素质教育机制分成以下几个类别:①组织领导机制。此类机制能够合理安排系统要素结构，协调职能部门间作用关系，总体保证在职硕士创新素质教育的实施方向，在整个机制群构成的链条中，组织领导机制处于绝对的统治地位，是其他机制构建和运行的基础;②运行机制，运行机制是由若干微观机制组成的机制集合，具体包括观念机制、教学机制、校园文化机制、导师模式培养机制、评价机制等。此类机制是在职硕士创新素质教育的具体实践方法，是系统要素的执行表现，在在职硕士创新素质教育过程中，上述机制分别在相应的子系统中对其要素组成或要素运行起作用，确保在职硕士创新素质教育在教学、管理、行政等不同运作环节顺利有效地开展实施;③反馈分析机制。此类机制是在职硕士创新素质教育自反馈和外部环境分析的功能单元，通过将反馈信息的有效回递，使在职硕士创新素质教育机制形成回路，提高在职硕士创新素质教育的效果和保障机制群的长期运行。
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