就培养目标的价值取向来说，学术型以学术价值的追求为主，着重理论水平的提高，适应社会对高科技专门人才的需求;职业型以职业价值的追求为主，着重掌握职业知识与技术，针对各行各业对专门人才的需求。工程硕士作为专业学位类型中的一种，在培养目标上要更突出应用性。工程硕士就是为工商业提供应用型人才，提供高层次的工程技术和管理者。美国的工程硕士教育就更突显这一特征，例如，康乃尔大学培养目标是:为商业、政府和工业培养技术专家。康奈尔大学的工程硕士培养目的是增加知识、扩展关系、提高就业机会。我国的工程硕士培养目标定位要更加鲜明的体现出工程硕士的这种应用性。
在当今的大工程观教育思想下，工程硕士作为作为高层次人才，工程硕士不仅要掌握相关工程理论、知识和技术，学生还要在此期间要学会如合理、适当、经济的解决工程问题。这需要工程硕士具有多方面的知识和能力。除了对前沿知识技术的把握，还必须要具有高度的责任感，具有相关的经济、管理、文化理解、交流沟通的能力。现代社会对工程人才提出的要求是高标准的，就要求我们的工程硕士这种高层次人才具备和掌握多种素质和能力。工程硕士是一种复合型人才，而绝非是单一类型的人才。工程硕士要掌握某一工程领域的基础理论和多学科的知识综合，集技术、管理和设计开发为一身。因此在其培养目标中必须体现这种社会对高素质高层次人才的需求，培养的人才必须是一种具备多种能力和素质的综合性人才。
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