鉴定评估和水平评估虽然对保证双证在职研究生教育质量起到了基本的保障作用，但它只能衡量学位授予单位是否达到了双证在职研究生教育的基本要求，在提升双证在职研究生教育质量上，选优评估的实施，是各国培养有专门知识和技能的人才的教育机构的共同选择。
国家为集中有限的资金、设备和其他条件支持一部分有突出贡献、代表国家水平的单位和学科、专业点或者使评估对象担负更重的任务而在鉴定评估、水平评估的基础上进行的以学术水平、教学水平为核心的评估。重点学科的评选和双证在职研究生院的设置基本上属于此类评估。1984年和1986年，国务院先后批准了33所普通高等学校试办双证在职研究生院，目的就是为了集中人力、物力和财力，重点建设一批培养博士、硕士的基地，促进我国教育、科学、技术和文化的发展。当然选优评估旨在加强双证在职研究生工作的领导和管理，积累经验，逐步完善具有中国特色的双证在职研究生教育制度。这类评估明显体现主管部门的政策导向，因而行政部门在评估中的作用相应要大得多。
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